De verschillende LIMNET-werkgroepen bespreken de laatste nieuwtjes op NME-gebied en wisselen ervaringen uit. Deskundigen uit de onderwijs en NME-sector geven advies bij het ontwikkelen van nieuwe NME-projecten.
LIMNET beschikt over een werkgroep Natuurcentra, een werkgroep Vorming, een werkgroep Basisonderwijs en een werkgroep Secundair onderwijs.
Elke werkgroep komt een aantal keer per jaar samen.